A través del recorrido y el análisis de la obra de Freud, desde sus inicios con Breuer en la hipnosis hasta la metapsicología, Los dilemas de Freud y la psicología sitúa justamente la polémica, aún inconclusa, de la controversia acerca de los dilemas en torno a la interpretación de su obra, por un lado, quienes incluyen y consideran el trabajo de Freud como parte de las ciencias naturales (Popper, Nagel y el Círculo Positivista de Viena), por otro, los que reconocen a Freud al hermeneuta en la búsqueda y la definición de sentidos y significados latentes, en el sueño como realización de los deseos, destacando en el estudio de la polémica que gira alrededor del psicoanálisis la carta de permanencia del debate sobre el lenguaje y su excesiva atomización en las diferentes ciencias (Paul Ricoeur, Jürgen Habermas, Herbert Marcuse y la Escuela de Francfort).
Marie Jahoda no sólo sitúa la polémica en torno a Freud, sino que intenta, en el rigor del estudio, desarrollarla paralelamente con el análisis de su obra, apuntando siempre datos claves de su vida para encontrar una justa relación entre la biografía y la obra.